例如某个文件有Version1-5，我希望4、5版本合并组成Version6。我是这样操作的：
Get lasted Version, Checkout, 从版本历史中Get Version4, 系统出现提示后选择Merge。 但是查看源码后发现，是Version 4覆盖了Version 5。VSS为何replace? 我已经选择了Merge。

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Merge一般是对于Branch来说的。象楼主这样的情况，完全可以手工Merge。

1、先Check Out
2、再把Version4 Get到另外的目录
3、手工或者利用工具把Version4和Check Out的版本合并一下
4、最后Check In

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